4. Si algo no cuadra

Las columnas de IVA no salen en el CSV. Comprueba el interruptor. Con él desactivado, el volcado del núcleo enumera los campos de la tabla, y estas columnas son calculadas: no existen en la base de datos. En pantalla y en PDF sí salen.
No veo las columnas nuevas en Opciones. Se crean al abrir esa pantalla. Si acabas de dar de alta un impuesto, vuelve a entrar.
La descarga sale completa aunque el interruptor esté activo. El interruptor es por vista: asegúrate de haberlo activado en la del listado que estás exportando, no en otra.
El PDF sale ilegible con muchas columnas. FacturaScripts reparte el ancho de la página a partes iguales, así que con veinte columnas cada una se queda en unos 13 mm y los textos largos se parten. El PDF sigue siempre a la pantalla, sin interruptor que lo module: para imprimir, deja visibles ocho o diez columnas.