Alberto. Perdona, no entiendo tu pregunta porque si es una persona física, se procesa como un español ya que le cobras el IVA. Por otra parte, en el formulario de creación del cliente, puedes indicar el país.
El VAT o NIF válido en operaciones intracomunitarias con empresas siempre incluye el código de país (FR para Francia, PT para Portugal, etc). Es más, deberías validar SIEMPRE que está registrado como operador intracomunitario en
Validación del n° IVA en VIES
No sé si es lo que tú preguntas o lo que tú necesitas.
Un cordial saludo.