Buenos, mucho cuidado pero vamos a hacerlo a mano...
Ten copia de seguridad y tal y tal... las recomendaciones de siempre..
Verás que cuanto entran el la ventana de la cuenta, arriba en la url verás algo como así
index.php?page=contabilidad_cuenta&id=390
Te en cuenta que te he dicho la cuenta... no la subcuenta..
Dentro de la cuenta estarán las subcuentas que quieres borrar y cada una cuando la pulsemos y no muestre en pantalla la subcuenta, en la url verás su id
Pues si en la url pones:
/index.php?page=contabilidad_cuenta&id=id_cuenta&deletes=id_subcuenta
Te quedaria una cosa parecida así
/index.php?page=contabilidad_cuenta&id=[b]390&deletes=
1051
poniendo esa línea en el navegador te borrará la subcuenta con id 1051, de la subcuenta id 390
Si tienes duda como hacerlo me lo preguntas otra vez y te mando imágenes.
No hagas nada si tienes dudas.
y si puedes hacerlo en un entorno de prueba mejor.
Saludos.